Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF5Q13568 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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