Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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IKZF1Q13422 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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IKZF1Q13422 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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IKZF1Q13422 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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IKZF1Q13422 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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IKZF1Q13422 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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IKZF1Q13422 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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