Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPS1Q13098 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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