Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXC1Q12948 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXC1Q12948 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXC1Q12948 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FOXC1Q12948 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FOXC1Q12948 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FOXC1Q12948 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FOXC1Q12948 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FOXC1Q12948 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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