Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
STX4Q12846 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
STX4Q12846 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms