Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
ARHGEF5Q12774 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARHGEF5Q12774 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms