Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPAL4Q0D2K0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms