Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLFN5Q08AF3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms