Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDE4DQ08499 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms