Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms