Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLTCQ00610 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLTCQ00610 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLTCQ00610 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLTCQ00610 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLTCQ00610 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms