Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COG7P83436 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COG7P83436 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms