Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HBBP68871 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HBBP68871 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HBBP68871 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms