Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms