Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN15P56746 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms