Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIA4P48058 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms