Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXA13P31271 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA13P31271 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms