Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms