Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XPAP23025 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XPAP23025 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XPAP23025 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XPAP23025 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XPAP23025 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XPAP23025 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XPAP23025 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XPAP23025 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XPAP23025 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XPAP23025 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XPAP23025 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XPAP23025 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XPAP23025 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XPAP23025 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XPAP23025 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XPAP23025 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XPAP23025 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XPAP23025 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms