Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LHCGRP22888 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms