Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRHP20396 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRHP20396 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRHP20396 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRHP20396 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRHP20396 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRHP20396 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRHP20396 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRHP20396 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRHP20396 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRHP20396 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRHP20396 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRHP20396 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRHP20396 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
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