Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TFE3P19532 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TFE3P19532 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TFE3P19532 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms