Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms