Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms