Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZBED1O96006 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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