Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CAPN9O14815 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPN9O14815 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms