Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ISM1B1AKI9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms