Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM2AQ9Y2K7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDM2AQ9Y2K7 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms