Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms