Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1490 ms