Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXD3Q9UJU5 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXD3Q9UJU5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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