Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNNA3Q9UI47 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms