Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHPF2Q9P2E5 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms