Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB6BQ9NRW1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms