Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
USP29Q9HBJ7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP29Q9HBJ7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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