Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL7

WDR12, Ribosome biogenesis protein WDR12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR12Q9GZL7 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
WDR12Q9GZL7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms