Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC3Q9BY71 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC3Q9BY71 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC3Q9BY71 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC3Q9BY71 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC3Q9BY71 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC3Q9BY71 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRRC3Q9BY71 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRC3Q9BY71 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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