Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG3Q96JB2 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms