Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms