Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PCDHA4-204ENST00000618834 10557 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CXorf38-203ENST00000378426 4895 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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COPS9Q8WXC6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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COPS9Q8WXC6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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COPS9Q8WXC6 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
COPS9Q8WXC6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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