Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CREB3L3Q68CJ9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms