Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CNGA3Q16281 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CNGA3Q16281 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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