Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMC1AQ14683 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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