Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CNGB1Q14028 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CNGB1Q14028 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CNGB1Q14028 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CNGB1Q14028 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB1Q14028 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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