Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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