Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD4Q13485 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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