Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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GRIK2Q13002 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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GRIK2Q13002 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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