Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FOXF1Q12946 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FOXF1Q12946 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FOXF1Q12946 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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FOXF1Q12946 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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