Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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RAB40BQ12829 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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RAB40BQ12829 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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RAB40BQ12829 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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RAB40BQ12829 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RAB40BQ12829 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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