Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD51Q06609 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms